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以应用研究为主，面向全国的水文水资源专业研究机构，简称南京水文所。南京水文所成立于1977年，其主要职责和任务是：①为国家制订国民经济和社会发展战略提供水文、水资源、水环境方面的决策依据；②承担国家重大水工程建设、水规划编制和水管理运行中与水文、水资源、水环境有关的重大技术课题；③发展水文、水资源、水环境科学中的基础理论和先进技术；④承担流域和地区性的水文、水资源、水环境等方面的科研和生产任务等。所长由水利部任命。所址在江苏省南京市西康路。 2000年底，南京水文所设有13个二级机构，包括5个研究室以及滁州实验基地、《水科学进展》编辑部和水文水资源培训中心。在职职工121人，其中具有研究生学历的46人（已获博士学位的2人，在职攻读博士学位的14人），大学本科学历的44人。具有专业技术职称者109人，其中高级职称的53人，中级职称的47人，初级职称的9人。 1979～1999年底，南京水文所完成重要科研项目400多个，包括国家科技攻关、国家自然科学基金、国家科技合作、水利部重点科研、水利部水利科研基金、横向协作等项目。专业范围主要有基础水文、水资源；防洪减灾；地理信息系统、遥感等新技术应用；水环境；技术标准等方面。其中获国家科技进步奖11项，省、部级奖40多项。正式出版专著20余部。 在国际合作方面，先后与联合国教科文组织国际水文计划（IHP）、世界气象组织（WMO）、国际水文科学协会（IAHS）、国际原子能机构（IAA）、国际标准化组织（ISO）、联合国亚洲及太平洋经济社会委员会（ESCAP）和30余个国家的水文、水资源机构和专家建立了广泛的学术、业务联系。南京水文所是IHP中国国家委员会副主席单位。 网址：http://www.njhri.edu.cn
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